国内刊号:11-1908/S
国际刊号:1001-7488
发布日期:
作者:李伟,其其格,黄旭,岳阳,尹靖琨,王瑞俭*
单位:北华大学林学院 吉林 132013
关键词:越桔属,蓝莓,栽培品种,DNA条形码,遗传分化
基金:吉林省重点科技研发项目(20180201005NY);国家林业局测试指南编制项目(2015009)
目的: 筛选出适合鉴别蓝莓品种的DNA条形码,用于蓝莓不同品种的区分及遗传分化研究。方法: 以40个蓝莓品种108份样品总DNA为模板,对8个条形码片段(rpoB、psbA-trnH、ycf5、rbcL、rpoC、matK、ITS、ITS2)进行扩增与测序,分析扩增效率及测序成功率、遗传距离、barcoding gap,并对遗传距离计算结果进行Wilcoxon检验,利用NJ树法对各蓝莓品种进行聚类分析。结果: 在8个DNA条形码中,ITS与ycf5在所有蓝莓样本中均无扩增产物。除matK序列扩增成功率(96.30%)、测序成功率(99.04%)相对较低外,其他5个条形码扩增与测序成功率均为100%。蓝莓的rpoB序列完全一致,为高度保守序列。各条形码的变异位点数依次为:ITS2(11个)> matK(4个)> rbcL(3个)> psbA-trnH(2个)> rpoC(1个)> rpoB(0个)。各蓝莓品种的品种内、品种间遗传距离较小,介于0.000 16~0.002 58之间,且品种间遗传距离大于品种内。Barcoding gap分析结果显示,各条形码均未形成明显的间隔区,但从分布情况看,ITS2、psbA-trnH、matK 3个条形码有偏向两端分布的趋势,尤其是ITS2。Wilcoxon检验显示,ITS2、psbA-trnH品种间变异较大,psbA-trnH品种内的变异较大。聚类分析结果表明,psbA-trnH和rpoC可将蓝莓品种分为2个类群,rbcL和matK将蓝莓划分为3个类群,ITS2将蓝莓分为4个类群。利用条形码组合可提高蓝莓品种鉴定率,其中ITS2+matK+rpoC+rbcL鉴定成功率最高,为20%。结论: ITS2对蓝莓品种的鉴定结果优于其他条形码,条形码组合ITS2+matK+rpoC+rbcL将40个蓝莓品种分为14组,能够将山东省主要的蓝莓栽培品种如伯克利、阳光蓝、北陆等品种区分开来,较适于蓝莓的品种鉴定。
来源:2019年第12期
《林业科学》期刊编辑部