林业科学

作者：潘文婷,孙建军,原勤勤,张利利,邓康桥,厉月桥*

单位：中国林业科学研究院亚热带林业实验中心 分宜 336600

关键词：鹅掌楸属,RAD测序,遗传多样性,遗传结构

基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(CAFYBB2016QA015)

目的: 揭示鹅掌楸属遗传结构和地理变异特点，为鹅掌楸属遗传资源的保存、利用及改良提供依据。方法: 以9个鹅掌楸种源97份样本和4个北美鹅掌楸种源46份样本为材料，采用RAD-seq测序鉴定各样本SNP标记，计算观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、核苷酸多样性(π)和基因分化系数(Gst)等遗传统计量指标，分析鹅掌楸属种源遗传多样性和遗传结构。结果: 在143份鹅掌楸属样本中共鉴定出4 454个高质量的SNP标记；鹅掌楸种源之间存在较大的遗传分化以及中水平的基因流(Gst=0.241 9、Nm=0.805 1)，北美鹅掌楸种源之间存在很大的的遗传分化以及低水平的基因流(Gst=0.388 6>0.25、Nm=0.397 0)；通过结构分析将13个鹅掌楸属种源分为3个类群，其中9个中国的鹅掌楸种源被分为东部种源群(即类群2)和西部种源群(即类群1)，类群3均为北美鹅掌楸，遗传多样性顺序为：类群3>类群1>类群2。结论: 鹅掌楸属遗传结构的形成与其地理隔离和片段化分布有关，且存在由于小群体效应和片段化影响导致的濒危现象，本研究开发的SNP标记可为鹅掌楸属分子鉴定、种质创新及种质资源收集与保存提供参考。

来源：2022年第4期

《林业科学》期刊编辑部

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