林业科学

作者：李丰钰1,黄平2,郑勇奇1,2,*,李长红2,张雨婷1,薛克娜3,宗亦臣2,赵鸿杰3

单位：1. 青岛农业大学园林与林学院　青岛 2661092. 国家林业和草原局植物新品种分子测定实验室　国家林业和草原局林木培育重点实验室　中国林业科学研究院林业研究所　林木遗传育种国家重点实验室　北京 1000913. 佛山市林业科学研究所　佛山 528234

关键词：山茶属,SSR标记,位点组合,品种鉴别能力,VDPtools

基金：国家林业与草原种质资源库（2005DKA21003）

目的: 筛选多态性高、通用性强等的SSR位点，评估筛选所得SSR位点的组合在山茶属品种中的鉴别能力；在保持最大鉴别能力的基础上，确定可用于山茶属品种鉴别所需的最少SSR位点的组合，提高品种鉴别效率。方法: 本研究以111份山茶属品种为材料，结合凝胶电泳、荧光毛细管电泳、位点多态性分析和位点组合品种鉴别力（VDP）分析等方法，筛选评价SSR位点并对SSR位点组合的品种鉴别力进行分析与评价。结果: 本研究筛选获得17个SSR位点，占筛选位点总数的30.9%，在111份山茶属品种中，共检测到166个等位基因，单位点基因型数量范围为6～35，均值为23.353个，观测等位基因数（Na）范围为3～15，均值为9.765个，多态性信息含量（PIC）的范围为0.447～0.835，均值为0.696，位点缺失率的范围为0～4.50%，均值为0.90%。当差异位点数=1时，17个SSR位点在全部品种（系）、红山茶组品种和金花茶组无性系中达到的R-VDP最大值均为1，可将SSR位点数量分别缩减到11、10、5个，分别占筛选所得位点数的64.7%，58.8%和29.4%；当差异位点数=2时，17个SSR位点在全部品种（系）、红山茶组品种和金花茶组无性系中达到的R-VDP最大值分别为0.964，0.952和1.000，可将SSR位点数量分别缩减到12、12、和7个，分别占筛选所得位点数的70.6%、70.6%和41.2%；当差异位点数=3时，17个SSR位点在全部品种（系）、红山茶组品种和金花茶组无性系中达到的R-VDP最大值分别为0.946，0.929，1.000，可将SSR位点数量分别缩减到8、7和8个，分别占筛选所得位点数的47.1%、41.2%和47.1%。当差异位点数≤6时，17个SSR位点组合对山茶属测试品种（系）群的R-VDP最大值可保持相对稳定的水平。结论: 本研究筛选验证获得17个多态性高、通用性强等的SSR位点；这些位点的组合在山茶属品种（系）群中均表现出良好的品种鉴别能力；确定了山茶属不同类群品种（系）鉴别所需的最少SSR位点的组合，构建了一套山茶属SSR位点组合品种鉴别能力分析评价的体系，为山茶属品种鉴别及相关标准的制定等奠定了基础。

来源：2023年第8期

《林业科学》期刊编辑部

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