林业科学

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),EI

国内刊号:11-1908/S

国际刊号:1001-7488

林业科学杂志2025年第11期:刺槐群体遗传多样性分析及其核心种质初步筛选

发布日期:

作者:梁燕1,王因花1,*,燕丽萍1,孔雨光2,李庆华1,仲伟国1,田泽新1,董元夫3,张元帅3

单位:1. 山东省林业科学研究院 山东省生态林草遗传育种重点实验室 济南 2500142. 山东省国土空间规划院 济南 2500143. 费县国有大青山林场 临沂 276000

关键词:刺槐,荧光SSR,遗传多样性,遗传结构,核心种质库

基金:山东省农业良种工程项目(2023LZGC012-2);泰山学者工程项目。

目的: 基于荧光SSR分子标记技术分析刺槐群体遗传多样性和遗传结构,初步筛选核心种质资源,为科学管理和保存刺槐种质资源、精确构建核心种质资源库以及有效提高育种效率提供理论参考。方法: 利用17对荧光SSR引物,分析来自美国阿巴拉契亚、北京、河南、山东、山西、辽宁6个种源地323份刺槐种质资源群体的遗传多样性和遗传结构,应用Gene Marker 2.2.0 结合POPGENE 32软件计算观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Shannon信息指数(I)、Nei’s基因多样性指数(H)和种群间F值。运用PowerMaker软件获得多态性信息含量(PIC)值。利用Structure软件分析刺槐种群结构,使用Python 3算法中的Evanno2005方法推断划分最佳遗传类群。采用最小距离逐步抽样法(LDSS)构建核心种质库后进行优化,t检验验证优化核心种质库的代表性。结果: 323份刺槐种质资源群体共扩增出135个等位基因,平均每对引物扩增7.941个等位基因,有效等位基因数均值2.808,Shannon信息指数均值1.200,观测杂合度均值0.191,期望杂合度均值0.588,Nei’s基因多样性指数均值0.589,多态信息含量均值0.544,表明刺槐群体遗传多样性较高;6个地理来源刺槐群体整体分析显示遗传多样性最高为辽宁、最低为北京;6个地理来源323份刺槐种质资源可划分为2个亚群,基因变异主要存在于种质资源个体间。最小距离逐步抽样法确定初始核心种质资源库最佳比例为20%,优化核心种质资源库比例为23.220%,确定248份保留种质、63份初始核心种质、12份补充种质,共筛选出75份核心种质,北京6份、河南8份、美国阿巴拉契亚17份、山西8份、山东29份、辽宁7份;核心种质资源库相比原始种质资源库Na保留比例100.00%,Ne、I、Ho、He和H分别增加0.423、0.245、0.267、0.192和0.197,t检验表明核心种质库能够充分代表原始种质资源群体的遗传多样性。结论: 323份刺槐种质资源群体遗传多样性处于较高水平,遗传结构与地理来源相关性较小,初步构建的核心种质库可为下一步的资源保护和高效利用提供参考。

来源:2025年第11期

《林业科学》期刊编辑部

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